✔ В 2008 году по инициативе Первого Президента был запущен проект “20 интеллектуальных школ естественно-математического направления для одаренных и талантливых детей”.

✔ Постановлением Правительства Республики Казахстан от 13 мая 2008 года №452 с целью реализации данного проекта, создания и обеспечения деятельности сети интеллектуальных школ и внедрения инновационных технологий в образовательной сфере создано Акционерное общество «Өркен».

✔ В августе-октябрь 2008 года  состоялся  конкурсный прием учителей в Интеллектуальную школу физико-математического направления города Астана. Претенденты проходили тестирование по предмету, писали эссе на заданную тему,  проходили собеседование. Для принятых на работу педагогов были организованы установочные курсы. В 2009-2010 учебном году в школе работало 85 учителей.

Конкурсный отбор. 2008 год.

✔ В  декабре 2008 года на базе средней школы № 59 города Астана проведён конкурсный отбор для 2210 учащихся, изъявивших желание учиться в школе для одаренных детей.  Конкурс проходил в два этапа:

❋ Этап 1: Комплексная проверка знаний по четырем предметам: математика, казахский язык, русский язык, английский язык.

❋ Этап 2: Определение уровня готовности к обучению в данной школе – выполнение 5 заданий трех уровней сложности (А, Б, С). В 2009-2010 учебном году в школе обучалось 792 учащихся.

✔ 12 января 2009 года  в здании школы по адресу ул Туркестан 2/1 торжественно открыта первая Интеллектуальная школа Первого Президента Республики Казахстан физико-математического направления города Астана. Первый Президент РК Нурсултан Абишевич Назарбаев дал первый звонок в Первой Интеллектуальной школе, поздравил первых учителей и учеников, посетил первые уроки.

На церемонию открытия школы были приглашены представители СУНЦ А. Н. Колмогорова при МГУ им. М. В. Ломоносова, «Школы будущего Сингапура», «Умных школ» из Южной Кореи.

✔ Согласно приказу МОН РК №636 от 4 декабря 2008 года, школа является экспериментальной площадкой по апробации

учебных программ физико-математического направления.

✔ 14 марта 2009 года принято Постановление Правительства РК № 317 «Об утверждении Правил присуждения и размеров образовательного гранта «Өркен» для оплаты обучения одаренных детей в Интеллектуальных школах РК.

✔ 19 января 2011 года принят Закон Республики Казахстан «О статусе «Назарбаев Университет», «Назарбаев Интеллектуальные школы» и «Назарбаев Фонд» для внедрения современной формы управления в сфере образования, развития академической свободы и автономности, необходимой для реализации инновационных образовательных программ и научных проектов.

✔ 2014-2015 учебный год Интеллектуальная школа начала в новом здании, которое находится по 31 улице, рядом с Назарбаев Университетом. Красивое, современное новое здание школы состоит из трех этажей, четырнадцати блоков, и прилегающая к нему территория занимает участок общей площадью 7,2 гектара.

✔ В октябре 2016 года Интеллектуальная школа физико-математического направления города Астана прошла международную аккредитацию Совета Международных школ  (Council of International Schools).